Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDRG4Q9ULP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDRG4Q9ULP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms