Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT11Q9UKZ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms