Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PILRAQ9UKJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PILRAQ9UKJ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms