Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMP5Q9UJQ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMP5Q9UJQ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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