Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms