Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRP68Q9UHB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms