Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms