Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms