Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EIF3KQ9UBQ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3KQ9UBQ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms