Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA5BQ9P283 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA5BQ9P283 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms