Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSRB1Q9NZV6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSRB1Q9NZV6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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