Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBAP1Q9NZ09 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBAP1Q9NZ09 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms