Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSD3Q9NYI0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSD3Q9NYI0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms