Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1C1Q9NYB5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms