Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VNN3Q9NY84 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms