Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A12Q9NXJ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms