Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD1Q9NUN5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMBRD1Q9NUN5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms