Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCM2LQ9NUG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms