Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDS5BQ9NTI5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms