Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH2B1Q9NRF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2B1Q9NRF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1215.3 ms