Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM7Q9NQW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM7Q9NQW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms