Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM8Q9NQV8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM8Q9NQV8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM8Q9NQV8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms