Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNA4Q9HCM2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms