Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PRKRIP1Q9H875 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRKRIP1Q9H875 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms