Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC13Q9H3R2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC13Q9H3R2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC13Q9H3R2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC13Q9H3R2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC13Q9H3R2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MUC13Q9H3R2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms