Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3J6

C12orf65, Probable peptide chain release factor C12orf65, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf65Q9H3J6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf65Q9H3J6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf65Q9H3J6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms