Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRMDAQ9H2I8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRMDAQ9H2I8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRMDAQ9H2I8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRMDAQ9H2I8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRMDAQ9H2I8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRMDAQ9H2I8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRMDAQ9H2I8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms