Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS11Q9H270 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms