Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF541Q9H0D2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF541Q9H0D2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms