Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGIF2Q9GZN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGIF2Q9GZN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms