Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms