Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1BQ9BZX4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms