Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM8Q9BZR9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms