Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUF2Q9BZD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUF2Q9BZD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUF2Q9BZD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms