Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms