Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms