Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUSAP1Q9BXS6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUSAP1Q9BXS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUSAP1Q9BXS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUSAP1Q9BXS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUSAP1Q9BXS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms