Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC12A9Q9BXP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A9Q9BXP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A9Q9BXP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms