Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF2Q9BWQ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF2Q9BWQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YIPF2Q9BWQ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
YIPF2Q9BWQ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YIPF2Q9BWQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YIPF2Q9BWQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF2Q9BWQ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF2Q9BWQ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms