Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSCC1Q9BVC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSCC1Q9BVC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSCC1Q9BVC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms