Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KATNB1Q9BVA0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KATNB1Q9BVA0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms