Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAMP8Q9BV40 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAMP8Q9BV40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms