Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFHD1Q9BUP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms