Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPOQ9BU64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms