Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDC1Q9BTX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDC1Q9BTX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms