Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PI4K2AQ9BTU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PI4K2AQ9BTU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms