Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERP44Q9BS26 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERP44Q9BS26 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms