Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms