Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX7

C7orf25, UPF0415 protein C7orf25, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf25Q9BPX7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C7orf25Q9BPX7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C7orf25Q9BPX7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms