Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP2Q99959 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms